В 1999 году вся планета Земля оказалась в большой опасности - к ней приближалась другая планета под названием Ла Металь. Юкино Яёй - учитель в средней школе, а также сотрудник обсерватории доктора Амамори. Но всё это - лишь маски. На самом деле Юкино Яёй - Королева Тысячелетия, что пришла с Ла Металь тысячу лет назад и с тех пор тайно направляла человечество.
Вскоре разразилась катастрофа, вызванная приближающейся планетой, и Хадзиме, один из учеников Яёй, примчался в апартаменты своей учительницы, чтобы помочь ей. Каково же было его удивление, когда он получил приглашение в тайное убежище глубоко под землёй.